ES biudžeto finansavimo šaltiniai įvairūs, tarp jų – tam tikra kiekvienos valstybės narės bendrųjų nacionalinių pajamų dalis. Šios lėšos leidžiamos siekiant įvairiausių tikslų, pavyzdžiui, didinti skurdesnių regionų gyvenimo lygį, užtikrinti maisto saugą.