Agencje zajmujące się poszczególnymi obszarami polityki UE podlegają europejskiemu prawu publicznemu; różnią się od instytucji UE (Rady, Parlamentu, Komisji itd.) i posiadają własną osobowość prawną. Ustanawia się je na mocy aktów prawa wtórnego w celu powierzenia im bardzo konkretnych zadań technicznych, naukowych lub w zakresie zarządzania.
Do Agencji tych należą obecnie: