Sono organismi di diritto pubblico europeo, distinti dalle istituzioni dell'UE (Consiglio, Parlamento europeo, Commissione, ecc.) e dotati di personalità giuridica. Sono istituiti con un atto di diritto derivato e svolgono compiti molto specifici di natura tecnica, scientifica o amministrativa.
Attualmente queste agenzie sono le seguenti: