As agências e os organismos descentralizados da UE dividem-se em várias categorias.

• Agências e órgãos de regulamentação
  A UE criou agências especializadas e descentralizadas para apoiar os Estados-Membros e os seus cidadãos. Estas agências são a resposta a um desejo de descentralização geográfica e à necessidade de fazer face a novas tarefas de carácter jurídico, técnico e/ou científico. As agências e órgãos de regulamentação abrangem:
  • Agências estratégicas
  • Agências de Política Externa e de Segurança Comum
  • Agências de cooperação policial e judiciária em matéria penal
• Agências e organismos da EURATOM
  Estes órgãos são criados para apoiar os objectivos do Tratado que institui a Comunidade Europeia da Energia Atómica (EURATOM), que tem como finalidade coordenar os programas de investigação dos Estados-Membros com vista à utilização pacífica da energia nuclear, contribuir para a partilha do conhecimento, das infra-estruturas e do financiamento da energia nuclear e para garantir o aprovisionamento energético em condições de segurança.
• Agências de execução
  As agências de execução são organismos criados nos termos do Regulamento (CE) nº 58/2003 do Conselho (JO L 11 de 16.1.2003) para efeitos da atribuição de determinadas tarefas relacionadas com a gestão de um ou mais programas comunitários. Estas agências, que são criadas por um determinado período de tempo, devem estar localizadas na sede da Comissão Europeia (Bruxelas ou Luxemburgo).
• Órgãos de supervisão do sector financeiro
  Em Janeiro de 2011 foram criados três órgãos europeus de supervisão do sector financeiro a fim de prevenir o aparecimento de riscos que ameacem a estabilidade do sistema financeiro.

O Instituto Europeu de Inovação e Tecnologia (IET) é um organismo independente e descentralizado da UE que reúne os melhores recursos no domínio científico, empresarial e educativo para promover a capacidade de inovação da União Europeia.