Vi sono diverse categorie di agenzie e organi decentrati dell'UE.

• Agenzie e organismi di regolamentazione
  Sono state istituite una serie di agenzie europee specializzate e decentrate per fornire aiuto e consulenza agli Stati membri e ai loro cittadini. Le agenzie rispondono al desiderio di decentrare geograficamente gli organismi dell'Unione europea e all'esigenza di far fronte a nuovi compiti di natura giuridica, tecnica e/o scientifica. Tra le agenzie e gli organismi di regolamentazione figurano:
  • Agenzie settoriali
  • Agenzie per la politica di sicurezza e di difesa comune
  • Agenzie per la cooperazione di polizia e giudiziaria in materia penale
• Agenzie e organismi di EURATOM
  Si tratta di organismi costituiti per realizzare gli obiettivi del trattato che istituisce la Comunità europea dell'energia atomica (trattato EURATOM). Gli obiettivi del trattato sono: coordinare i programmi di ricerca degli Stati membri per l'utilizzazione pacifica dell'energia nucleare, mettere a disposizione conoscenze, infrastrutture e finanziamenti per lo sviluppo dell'energia nucleare e assicurare un approvvigionamento sufficiente e sicuro di energia atomica.
• Agenzie esecutive
  Sono organizzazioni istituite secondo il regolamento (CE) n. 58/2003 del Consiglio (GU L 11 del 16.1.2003) , per svolgere determinati compiti relativi alla gestione di uno o più programmi comunitari. Queste agenzie hanno una durata determinata e devono essere ubicate nella sede della Commissione europea (Bruxelles o Lussemburgo).
• Organi di vigilanza finanziaria
  Nel gennaio 2011 sono state istituite tre autorità europee di vigilanza per prevenire l’emergere di rischi in grado di compromettere la stabilità del sistema finanziario nel suo complesso.

L'Istituto europeo di innovazione e tecnologia (EIT) è un organo indipendente e decentrato dell'UE che riunisce le migliori risorse in campo scientifico, imprenditoriale ed educativo per promuovere la capacità di innovazione dell'Unione europea.