Az EU ügynökségei és decentralizált szervei több különböző kategóriába sorolhatók be.

• Szabályozási ügynökségek és szervek
  Tagállamainak és polgárainak támogatása céljából az Európai Unió számos szakosodott és decentralizált ügynökséget hozott létre. Ezeket az ügynökségeket a földrajzi decentralizáció iránti igény, illetve a jogi, technikai és/vagy tudományos jellegű új feladatok megoldásának szükségessége hívta életre. A szabályozási ügynökségek és szervek az alábbiakat foglalják magunka:
  • Politikai ügynökségek
  • Közös kül- és biztonságpolitikai ügynökségek
  • A büntetőügyekben folytatott rendőrségi és igazságügyi együttműködési ügynökségek
• Euratom-ügynökségek és -szervek
  Ezek a szervek az Európai Atomenergia-közösséget létrehozó szerződés (Euratom-Szerződés) célkitűzéseinek megvalósítását szolgálják. A szerződés célja az, hogy összehangolja a nukleáris energia békés célokra történő felhasználására irányuló tagállami kutatási programokat, továbbá hogy biztosítsa az atomenergia felhasználásához szükséges ismereteket, infrastruktúrát és finanszírozást, illetve azt, hogy az atomenergia-ellátás mennyiségileg megfelelő és biztonságos legyen.
• A végrehajtó ügynökségek
  A végrehajtó ügynökségek az 58/2003/EK tanácsi rendelet (HL L 11., 2003.1.16.) értelmében létrehozott olyan szervezetek, amelyeket egy vagy több közösségi program irányításához kapcsolódó bizonyos feladatokkal terveznek megbízni. Ezen ügynökségeket meghatározott időtartamra hozzák létre. Az Európai Bizottság (brüsszeli vagy luxemburgi) székhelyén kell létesíteni őket.
• Pénzügyi felügyeleti szervek
  A pénzügyi rendszer egészének stabilitását fenyegető veszélyek megelőzésére 2011 januárjában három európai felügyeleti szerv megalapítására került sor.

Az Európai Innovációs és Technológiai Intézet (EIT) független, decentralizált uniós szerv, amely a tudományos, üzleti és oktatási téren rendelkezésre álló legjobb erőforrások egyesítése révén erősíti az Unió innovációs kapacitását.