Les agences et organismes décentralisés de l'Union européenne peuvent être classés en plusieurs catégories.

• Agences et organes de réglementation
  Un certain nombre d’agences spécialisées et décentralisées ont été mises en place afin d’apporter un soutien aux États membres de l’UE et à leurs citoyens. Leur création répond à une volonté de déconcentration géographique et à une nécessaire adaptation à de nouvelles tâches de nature juridique, technique et/ou scientifique. Les agences et organes de réglementation peuvent être classés ainsi:
  • Agences liées aux politiques de l'UE
  • Agences pour la politique de sécurité et de défense commune
  • Agences de coopération policière et judiciaire en matière pénale
• Agences et organes EURATOM
  Ces organismes ont été créés pour contribuer à la réalisation des objectifs du traité instituant la Communauté européenne de l'énergie atomique (Euratom). Ces objectifs sont les suivants: assurer la coordination des programmes de recherche des États membres en vue d'une utilisation pacifique de l'énergie nucléaire, permettre la mise en commun des connaissances, des infrastructures et du financement de l'énergie nucléaire, et veiller à ce que l'approvisionnement en énergie atomique se fasse en quantité suffisante et en toute sécurité.
• Agences exécutives
  Les agences exécutives sont des organismes institués en application du règlement (CE) n° 58/2003 du Conseil (JO L 11 du 16.1.2003) en vue de certaines tâches relatives à la gestion d’un ou de plusieurs programmes communautaires. Ces agences sont créées pour une durée déterminée. Leur siège doit être établi au siège de la Commission européenne (à Bruxelles ou à Luxembourg).
• Organismes de surveillance financière
  Trois autorités européennes de surveillance ont été établies en janvier 2011 afin de prévenir l'accumulation de risques susceptibles de mettre en péril la stabilité de tout le système financier.

L'Institut européen d'innovation et de technologie (EIT) est un organisme indépendant et décentralisé de l'Union européenne qui met en commun les meilleures ressources scientifiques, économiques et académiques pour renforcer les capacités d'innovation de l'UE.